故事讲述了被分到问题学生云集的D班(bān )的绫小路清隆(lóng )和他的同学们(men )在学校里挣扎求生(shēng )的故事。在TV动画第四季《欢迎来到实力至上主义教室 第四季：二年级第一学期》中，春假过后，绫小路和轻井泽成为了情侣，而堀北也不再崇拜她才华横溢的哥哥岳。随着他们关系的逐渐变化，他们也升入了二年级。绫小(xiǎo )路和其他二年(nián )级新生即将(jiāng )迎来他们的第一场特殊考试——笔试，他们将与一年级(jí )新生搭档。然而，一年级新生中(zhōng )竟潜伏着月城从白屋派来的刺客。这种跨越年级界限的全新关系，究竟会带来风(fēng )暴还是平静？校园生活的第二年就此拉开帷幕。