故事讲述了被分到问题学生云集的D班的绫小路清隆和他的同学们在学校里挣扎求生的故事(shì )。在TV动画第四季《欢迎来到实力至上主义教室 第四季：二年级第一学期》中，春假过后，绫小路和轻井泽成为了情侣(lǚ )，而堀北也不再崇拜她才华横溢的哥哥岳。随(suí )着他们关系的逐渐变化，他们也升入了二年(nián )级。绫小路和其他二年级新(xīn )生即将迎来他们的(de )第一场特殊考试——笔(bǐ )试，他们将与一年级新生搭档。然而，一年级新生中竟潜(qián )伏着月城(chéng )从白屋派来的刺客。这种跨越年级界限的全新关系，究竟会带(dài )来风暴还(hái )是平静？校园生活的第二年就此拉开帷幕。