某日，一群使用风遁之术的空忍空袭火之国，无数民众和忍者遇害，形势危急。据纲手大人(rén )所言，这群不速之客正是在第二次忍者大战中落败的空之团，如今他们怀着复仇之心再次出现。卡卡西（井上和彦 配音）等人则负责(zé )侦查空之团的老巢，鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）、雏田（水樹奈々 配音）受命组成三人医疗小队，协助名医(yī )神农（石塚(zhǒng )運昇 配音）前往其徒弟雨琉的家乡医治伤者(zhě )。另一方面，病入(rù )膏肓的大蛇丸得知神农的再生(shēng )之(zhī )术业已完(wán )成，他命佐(zuǒ )助（杉山纪彰 配音）前去寻找神农。这也促成佐助和昔日伙伴宿命的重逢……　　本片为《火影忍者》第五部剧场版动画。