某日，一群使用(yòng )风遁之术的空忍空袭火之国，无数民众和忍者遇害，形势危急。据纲手大人所言，这群不速之客正是在第二次忍者大(dà )战中落败的空之(zhī )团，如今他们(men )怀着复仇之心(xīn )再次出现。卡卡西（井上和彦 配音）等人则负责侦查空之团的老巢，鸣(míng )人（竹内顺子 配音）、小樱（中(zhōng )村千绘 配音）、雏田（水樹奈々 配音）受命组成(chéng )三人医疗小队，协助名医神农（石塚運昇 配音）前往其徒弟(dì )雨琉的家乡医治伤者。另一方面，病入膏肓的大蛇丸得知神农的再生之术业(yè )已完成，他命佐(zuǒ )助（杉山纪彰 配音）前去寻找神农。这也(yě )促成佐(zuǒ )助和昔日伙伴宿命的重逢……　　本片为《火影忍者》第五部剧场版动画。